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磁気ディスクのセクタ配置をすべてやり直す操作のこと。「低レベルフォーマット」「物理フォーマット」とも呼ばれる。ディスクの全領域に渡ってセクタ情報を書き直すため、通常のフォーマットとは比べ物にならないほど膨大な時間を要する。ローレベルフォーマットされたディスクの内容は完全に消去され、いかなる手段を用いても復旧できなくなる。
ディスクを使用するには最低1回ローレベルフォーマットを行う必要があるが、1回ローレベルフォーマットが行われたディスクであれば、異なるファイルシステムで使用する場合もローレベルフォーマットを行う必要はない。
市販されているハードディスクやMOなどの大容量記憶媒体は、既にローレベルフォーマット済みの状態で販売されているが、フロッピーディスクはローレベルフォーマットがされていない状態で販売されていることが多い。